La taille des cellules procaryotes est généralement comprise entre 0,2 et 2 micromètres de diamètre, tandis que celle des cellules eucaryotes est comprise entre 10 et 100 micromètres de diamètre.
Les eucaryotes sont appelés « vrais noyaux » parce qu’ils contiennent des noyaux membranaires et d’autres organites tels que les lysosomes, le complexe de Golgi, le réticulum endoplasmique, les mitochondries et les chloroplastes, alors que les procaryotes n’ont pas de membrane nucléaire ni d’autres organites membranaires.
Chez les procaryotes, le flagelle est constitué de deux blocs de protéines et la paroi cellulaire est chimiquement complexe et constituée de peptidoglycane (un seul grand polymère d’acides aminés et de sucre), tandis que le flagelle des eucaryotes est plus complexe avec de multiples microtubules et, lorsque des parois cellulaires sont présentes, elles sont chimiquement simples.
Chez les procaryotes, la division cellulaire se fait par fission binaire et il n’y a pas de méiose, mais seulement un transfert de fragments d’ADN par conjugaison. Chez les eucaryotes, la division cellulaire se fait par mitose et la reproduction sexuée par méiose.
Chez les eucaryotes, la membrane plasmique est constituée de stérols et d’hydrates de carbone. Le cytoplasme est constitué de cytosquelettes et de flux cytoplasmiques. Les ribosomes sont plus grands (80S) et plus petits (70S), et les chromosomes sont multiples et disposés linéairement avec des histones. L’ADN des eucaryotes est beaucoup plus complexe que celui des procaryotes.
Chez les procaryotes, la membrane plasmique ne contient pas d’hydrates de carbone ni de stérols. Le cytoplasme ne contient pas de cytosquelette ni de flux cytoplasmique. Les ribosomes sont plus petits (70S) et se présentent avec un seul chromosome circulaire qui n’est pas constitué d’histones.